25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_C0017 on replicon NC_008265
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008265  CPR_C0017  HNH endonuclease domain protein  100 
 
 		 144 aa  293  7e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1453  hypothetical protein  39.58 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  42.05 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  39.02 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  35 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  33.75 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  33.75 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3808  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  35.87 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4096  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  35.87 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  35.96 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  26.67 
 
 		 408 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0656  gp65  33 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1374  gp65  33.33 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0798155 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0383  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  31.03 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  36.11 
 
 		 99 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  36.11 
 
 		 99 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  28.71 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1652  restriction endonuclease  28.41 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  33.75 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0027  hypothetical protein  34.67 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  28.71 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>