74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2845 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  100 
 
 
119 aa  246  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  93.28 
 
 
119 aa  232  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  89.92 
 
 
119 aa  223  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  68.38 
 
 
119 aa  177  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  66.1 
 
 
118 aa  169  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  58.26 
 
 
115 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  47.5 
 
 
126 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  39.32 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  35.16 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  35.71 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  41.03 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  36.36 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  35.29 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  36.52 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  34.62 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  34.92 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  36.75 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  35.83 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  36.13 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  34.78 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  32.65 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  31.03 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  41.46 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  38.03 
 
 
253 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  36.78 
 
 
111 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  36.49 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  36.49 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  38.98 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  32.05 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  35.53 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  29.2 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  36.28 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  29.41 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0239  HNH endonuclease  44.68 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628589  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  32.28 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  43.08 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  34.52 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  40.28 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  37.1 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  36.11 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  31.43 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  32.58 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  32.58 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  33.73 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  35.37 
 
 
277 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  39.06 
 
 
240 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  43.75 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  32.81 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  37.33 
 
 
187 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  38.71 
 
 
164 aa  43.5  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  32.18 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  32.2 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2519  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1959  HNH endonuclease  44.68 
 
 
334 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4096  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  36.56 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  30 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  37.18 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  33.33 
 
 
282 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  47.17 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  35.06 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3808  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  36.56 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  37.68 
 
 
163 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  45.65 
 
 
221 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  35.19 
 
 
125 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  34.62 
 
 
330 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08210  HNH endonuclease  40.26 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00377503  hitchhiker  0.00349678 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  33.85 
 
 
185 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  56.67 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  41.46 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0017  HNH endonuclease domain protein  28.71 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  37.14 
 
 
177 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  35.09 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  33.85 
 
 
191 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  28.71 
 
 
133 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>