19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0823 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0823  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  306  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0832  hypothetical protein  98 
 
 
150 aa  301  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0924  hypothetical protein  98 
 
 
150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.396091  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0483  hypothetical protein  98 
 
 
150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0962  hypothetical protein  98 
 
 
150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4066  hypothetical protein  96.64 
 
 
154 aa  294  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263898  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2435  hypothetical protein  92.62 
 
 
151 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3098  hypothetical protein  87.33 
 
 
152 aa  276  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2011  hypothetical protein  87.33 
 
 
152 aa  276  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3063  hypothetical protein  87.33 
 
 
152 aa  276  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3010  hypothetical protein  87.33 
 
 
152 aa  276  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2602  hypothetical protein  87.33 
 
 
152 aa  276  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0769  hypothetical protein  87.33 
 
 
152 aa  276  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2141  hypothetical protein  87.33 
 
 
152 aa  276  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1544  hypothetical protein  87.92 
 
 
172 aa  276  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0897  hypothetical protein  86 
 
 
181 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3097  hypothetical protein  86 
 
 
161 aa  249  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.295919  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0623  hypothetical protein  80.56 
 
 
216 aa  244  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  26.97 
 
 
279 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>