18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31890 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_31890  Retron-type reverse transcriptase protein  100 
 
 		 65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  52.38 
 
 		 560 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  52.38 
 
 		 560 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  48.44 
 
 		 568 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  48.39 
 
 		 561 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  47.46 
 
 		 565 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  49.02 
 
 		 549 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  51.02 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  47.62 
 
 		 571 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  47.46 
 
 		 568 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  47.54 
 
 		 566 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 569 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  41.54 
 
 		 585 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  41.54 
 
 		 585 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  41.54 
 
 		 585 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0112  RNA-directed DNA polymerase  52 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.690611  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 330 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>