76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_C0038 on replicon NC_008265
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0909  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4345  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.759199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  37.88 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  35.94 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  37.5 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4206  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000156355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 209 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  38.24 
 
 		 251 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 242 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  34.85 
 
 		 220 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4920  putative phage repressor  27.96 
 
 		 255 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1708  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0192115  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1743  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 402 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  36.51 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  36.51 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  30.3 
 
 		 244 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 237 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  34.38 
 
 		 230 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 237 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  32.26 
 
 		 261 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0845  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000284644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1824  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 117 aa  42.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0930  transcriptional regulator  42.22 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00205943  normal  0.115025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  25 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  25 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 72 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  28.99 
 
 		 244 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 71 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0094  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 66 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  39.22 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  33.9 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1213  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 394 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00829806  decreased coverage  0.0000499416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  29.23 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  30.3 
 
 		 244 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6072  putative transcriptional regulator Cro/CI family  29.33 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  27.63 
 
 		 259 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1063  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.150252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 282 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  36.54 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  37.5 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  40 
 
 		 69 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2992  hypothetical protein  36.54 
 
 		 67 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.169879  hitchhiker  0.00733208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>