12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4608 on replicon NC_013167
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013167  Cyan8802_4608  HNH endonuclease  100 
 
 
101 aa  211  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0097  HNH endonuclease  44.21 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0823152  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0046  hypothetical protein  32.98 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0348  hypothetical protein  29.2 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3890  hypothetical protein  32.05 
 
 
367 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5801  hypothetical protein  32.05 
 
 
367 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0386752  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4822  hypothetical protein  30.77 
 
 
367 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0006  HNH nuclease  32.88 
 
 
287 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457974  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0383  HNH endonuclease  28.12 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1678  hypothetical protein  35.37 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0391359  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4302  HNH endonuclease  33.9 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.111251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>