11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3890 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3890  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  767    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4822  hypothetical protein  98.09 
 
 		 367 aa  756    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5801  hypothetical protein  99.73 
 
 		 367 aa  764    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0386752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0453  hypothetical protein  35.77 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0100448  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0006  HNH nuclease  35.71 
 
 		 287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457974  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6676  HNH endonuclease  45.16 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000780736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0097  HNH endonuclease  36.11 
 
 		 102 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0823152  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4608  HNH endonuclease  32.05 
 
 		 101 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30 
 
 		 2136 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  32.81 
 
 		 282 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  34.85 
 
 		 587 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>