10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0097 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0097  HNH endonuclease  100 
 
 
102 aa  215  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0823152  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4608  HNH endonuclease  44.21 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0046  hypothetical protein  35.79 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3890  hypothetical protein  36.11 
 
 
367 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5801  hypothetical protein  36.11 
 
 
367 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0386752  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4822  hypothetical protein  33.33 
 
 
367 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  30.26 
 
 
587 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6676  HNH endonuclease  33.78 
 
 
260 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000780736  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4302  HNH endonuclease  39.66 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.111251  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1851  HNH endonuclease  53.57 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>