16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0545 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0545  gp82  100 
 
 		 79 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.719132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  90.91 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  48.05 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  48.05 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  48.05 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  39.51 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  38.16 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  32.47 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  34.18 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  35 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  35.44 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  35.9 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  34.18 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  33.73 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  48.89 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>