180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3946 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3946  HNH endonuclease  100 
 
 
151 aa  303  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0276  HNH nuclease  44 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  40.24 
 
 
199 aa  58.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  36.56 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  45.16 
 
 
173 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  43.55 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3190  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  37.14 
 
 
191 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  43.55 
 
 
174 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  42.19 
 
 
213 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  41.54 
 
 
459 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  43.08 
 
 
427 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  45 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  41.54 
 
 
459 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  41.27 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  42.42 
 
 
438 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  43.75 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  45.9 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  43.55 
 
 
165 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  35.29 
 
 
185 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  36.78 
 
 
186 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  41.94 
 
 
165 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  43.55 
 
 
160 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  40.45 
 
 
179 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  40 
 
 
183 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  41.94 
 
 
167 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  49.21 
 
 
221 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4871  HNH nuclease  46.15 
 
 
353 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.98872 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  36.62 
 
 
174 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  37.84 
 
 
174 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  36.59 
 
 
177 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  41.54 
 
 
459 aa  50.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  36.73 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  40.32 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  33.8 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  35.21 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  37.65 
 
 
202 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  38.71 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  43.33 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  40.32 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  45.76 
 
 
198 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1208  HNH nuclease  46.15 
 
 
352 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  41.94 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  38.71 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  40.32 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  45.45 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  38.71 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  34.25 
 
 
189 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  40.32 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  38.71 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  34.94 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  38.37 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  38.89 
 
 
182 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  42.37 
 
 
196 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  35 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  37.1 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  40.85 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  43.55 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3583  HNH nuclease  43.4 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  41.18 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  35 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  40.68 
 
 
181 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  38.37 
 
 
183 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  41.67 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  40.32 
 
 
174 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  38.89 
 
 
182 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  38.24 
 
 
204 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  43.75 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  36.25 
 
 
194 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  41.38 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  38.89 
 
 
182 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  44.07 
 
 
220 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  39.39 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  36.99 
 
 
187 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  38.81 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  40.32 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  40.32 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  41.79 
 
 
175 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  38.71 
 
 
197 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  38.71 
 
 
168 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0932  HNH nuclease  39.62 
 
 
353 aa  47  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.362218  hitchhiker  0.00171926 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  39.39 
 
 
167 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  36 
 
 
169 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  37.1 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  40.68 
 
 
315 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  44.64 
 
 
165 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  38.24 
 
 
198 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  38.71 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  34.69 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  37.1 
 
 
189 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  39.68 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  35.29 
 
 
443 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  37.36 
 
 
222 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  37.31 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  39.68 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  38.24 
 
 
198 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  31.76 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  36.92 
 
 
471 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  39.19 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  34.48 
 
 
185 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>