15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1268 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1268  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1469  hypothetical protein  85.92 
 
 		 206 aa  299  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.22306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0817  hypothetical protein  63 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17840  protein of unknown function (DUF1535)  57 
 
 		 299 aa  132  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1360  surface lipoprotein-related protein  37.44 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.813334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0882  surface lipoprotein-related protein  54.64 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1146  hypothetical protein  51.06 
 
 		 169 aa  99  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000279889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1227  hypothetical protein  49.5 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000082221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3919  protein of unknown function DUF1535  40 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  31.94 
 
 		 904 aa  61.2  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3380  hypothetical protein  34.83 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00652968  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22490  hypothetical protein  36.27 
 
 		 304 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.659605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33750  protein of unknown function (DUF1535)  35.56 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0453  hypothetical protein  31.33 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.387567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  36.56 
 
 		 585 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>