11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0453 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0453  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.387567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0597  hypothetical protein  43.75 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0699  hypothetical protein  23.72 
 
 		 171 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.385809  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4115  hypothetical protein  43.75 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146892  hitchhiker  0.0000000337837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2742  hypothetical protein  32 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.890417  normal  0.834874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2180  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0163358  unclonable  0.000000274139 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4323  hypothetical protein  30.83 
 
 		 682 aa  41.6  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1469  hypothetical protein  50 
 
 		 206 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.22306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3244  sporulation domain-containing protein  30.51 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.278143  normal  0.879472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3523  sporulation domain-containing protein  30.51 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2449  sporulation domain protein  30.51 
 
 		 221 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>