11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4115 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4115  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  288  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146892  hitchhiker  0.0000000337837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2654  hypothetical protein  47.46 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3397  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342391  hitchhiker  0.0000000000000798644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2180  hypothetical protein  38.03 
 
 
163 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0163358  unclonable  0.000000274139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1791  hypothetical protein  40.85 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4323  hypothetical protein  43.64 
 
 
682 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3244  sporulation domain-containing protein  36.67 
 
 
189 aa  42  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.278143  normal  0.879472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3523  sporulation domain-containing protein  36.67 
 
 
189 aa  42  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.212808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1950  sporulation domain-containing protein  39.06 
 
 
212 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2449  sporulation domain protein  36.67 
 
 
221 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0453  hypothetical protein  43.75 
 
 
176 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.387567  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>