21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2243 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2243  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.116823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1173  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2929  hypothetical protein  35.88 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.593374  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06230  hypothetical protein  30.77 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.98748  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1604  hypothetical protein  33.81 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352848  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0260  hypothetical protein  30.15 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000331823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1631  hypothetical protein  27.01 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3580  hypothetical protein  30.08 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25600  hypothetical protein  38.2 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.52807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1319  hypothetical protein  25.38 
 
 
235 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 
616 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0997  hypothetical protein  43.75 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4309  hypothetical protein  43.75 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1692  hypothetical protein  26.21 
 
 
281 aa  54.3  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1886  hypothetical protein  26.32 
 
 
331 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1850  hypothetical protein  26.32 
 
 
331 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1052  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 
613 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1036  hypothetical protein  28.57 
 
 
123 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0475  hypothetical protein  24.17 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314624  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0765  hypothetical protein  30.34 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.389785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>