28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0260 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0260  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000331823  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1319  hypothetical protein  44.44 
 
 
235 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25600  hypothetical protein  54.69 
 
 
239 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.52807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06230  hypothetical protein  37.22 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.98748  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1631  hypothetical protein  41.11 
 
 
226 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1692  hypothetical protein  41.86 
 
 
281 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3580  hypothetical protein  41.67 
 
 
213 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1052  hypothetical protein  36.43 
 
 
237 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 
613 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1036  hypothetical protein  35.71 
 
 
123 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0765  hypothetical protein  33.01 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.389785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2243  hypothetical protein  29.71 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.116823  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
520 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1602  hypothetical protein  32.84 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1604  hypothetical protein  30.52 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352848  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 
616 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1886  hypothetical protein  27.14 
 
 
331 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1850  hypothetical protein  27.14 
 
 
331 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0369  hypothetical protein  35.09 
 
 
127 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1173  hypothetical protein  25.88 
 
 
187 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2929  hypothetical protein  27.45 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.593374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5534  hypothetical protein  29.2 
 
 
172 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1412  hypothetical protein  31.9 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.709338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2961  hypothetical protein  27.62 
 
 
186 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1146  hypothetical protein  25.98 
 
 
434 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000825613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0814  hypothetical protein  27.07 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364035  hitchhiker  0.0000204544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2854  hypothetical protein  21.74 
 
 
179 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000499233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1255  hypothetical protein  23.39 
 
 
439 aa  42  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.249297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>