23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1631 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1631  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0260  hypothetical protein  45.77 
 
 
207 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000331823  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25600  hypothetical protein  47.69 
 
 
239 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.52807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1319  hypothetical protein  35.1 
 
 
235 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 
613 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1052  hypothetical protein  32.32 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0765  hypothetical protein  32.52 
 
 
230 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.389785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1036  hypothetical protein  37.88 
 
 
123 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488151  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06230  hypothetical protein  29.68 
 
 
260 aa  85.9  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.98748  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3580  hypothetical protein  36.15 
 
 
213 aa  85.1  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2243  hypothetical protein  29.23 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.116823  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
520 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
616 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0369  hypothetical protein  42.75 
 
 
127 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1602  hypothetical protein  30.5 
 
 
204 aa  62  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2929  hypothetical protein  30.87 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.593374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1173  hypothetical protein  34.57 
 
 
187 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1692  hypothetical protein  29.58 
 
 
281 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1886  hypothetical protein  26.4 
 
 
331 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1850  hypothetical protein  26.4 
 
 
331 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0055  hypothetical protein  31.11 
 
 
176 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15818  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1604  hypothetical protein  28.9 
 
 
241 aa  45.1  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2961  hypothetical protein  28.95 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>