18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1602 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1602  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1319  hypothetical protein  32.54 
 
 		 235 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06230  hypothetical protein  39.52 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.98748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0260  hypothetical protein  31.52 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000331823  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0765  hypothetical protein  29.32 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1631  hypothetical protein  26.37 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25600  hypothetical protein  31.16 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.52807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 616 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1850  hypothetical protein  29.55 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1886  hypothetical protein  29.55 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1604  hypothetical protein  27.09 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2961  hypothetical protein  26.99 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1692  hypothetical protein  29.8 
 
 		 281 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  23.62 
 
 		 613 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  23.49 
 
 		 520 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1412  hypothetical protein  28.93 
 
 		 195 aa  44.7  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.709338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1173  hypothetical protein  25.88 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1052  hypothetical protein  28.23 
 
 		 237 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.0269502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>