26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25600  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  457  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.52807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06230  hypothetical protein  45.97 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.98748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0260  hypothetical protein  54.14 
 
 		 207 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000331823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1631  hypothetical protein  41.24 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1319  hypothetical protein  35.5 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3580  hypothetical protein  44.62 
 
 		 213 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 		 613 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0765  hypothetical protein  41.79 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1052  hypothetical protein  31.31 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1692  hypothetical protein  34.93 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  34.1 
 
 		 616 aa  82  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1604  hypothetical protein  34.07 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1036  hypothetical protein  34.62 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2243  hypothetical protein  27.33 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.116823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1173  hypothetical protein  30.81 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1602  hypothetical protein  32.73 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2929  hypothetical protein  30.67 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.593374  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1886  hypothetical protein  28.77 
 
 		 331 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1850  hypothetical protein  28.77 
 
 		 331 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0369  hypothetical protein  37.82 
 
 		 127 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2854  hypothetical protein  28.07 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000499233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2961  hypothetical protein  28 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0709  hypothetical protein  26.74 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5534  hypothetical protein  28.97 
 
 		 172 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3653  hypothetical protein  27.12 
 
 		 407 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>