25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1052 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1052  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  480  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1036  hypothetical protein  99.19 
 
 
123 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0765  hypothetical protein  41.46 
 
 
230 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.389785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0260  hypothetical protein  34.75 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000331823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1631  hypothetical protein  38.64 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25600  hypothetical protein  34.88 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.52807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06230  hypothetical protein  26.88 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.98748  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3580  hypothetical protein  40.91 
 
 
213 aa  79  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1319  hypothetical protein  26.32 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
613 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1692  hypothetical protein  31.94 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  31 
 
 
616 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1173  hypothetical protein  25.39 
 
 
187 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2929  hypothetical protein  30.36 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.593374  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 
520 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2243  hypothetical protein  25.13 
 
 
191 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.116823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0369  hypothetical protein  34.71 
 
 
127 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6231  Scramblase family protein  61.29 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0305  hypothetical protein  52.94 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0454442  normal  0.0588039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2679  hypothetical protein  56.25 
 
 
322 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7675  hypothetical protein  53.85 
 
 
431 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0692  hypothetical protein  55.56 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7834  ATP/GTP binding protein  59.26 
 
 
664 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.675411  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0488  hypothetical protein  52.94 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.959015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1442  hypothetical protein  47.5 
 
 
351 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.268865  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>