23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6231 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6231  Scramblase family protein  100 
 
 
279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3844  scramblase family protein  61.68 
 
 
329 aa  278  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3637  Scramblase family protein  33.16 
 
 
200 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855043  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5036  scramblase family protein  24.23 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3844  Scramblase family protein  22.41 
 
 
198 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7675  hypothetical protein  56.52 
 
 
431 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3021  hypothetical protein  27.27 
 
 
197 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13517  hypothetical protein  57.58 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.15754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2679  hypothetical protein  63.33 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1442  hypothetical protein  59.26 
 
 
351 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.268865  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1052  hypothetical protein  69.23 
 
 
237 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07460  hypothetical protein  23.53 
 
 
193 aa  46.2  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.192157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7834  ATP/GTP binding protein  43.9 
 
 
664 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.675411  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3893  hypothetical protein  68 
 
 
111 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07980  Protein of unknown function (DUF2510)  51.61 
 
 
354 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0996646  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0488  hypothetical protein  20.22 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.959015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1443  peptidase domain protein  58.62 
 
 
442 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02780  conserved hypothetical protein  25 
 
 
462 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0692  hypothetical protein  55.56 
 
 
200 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0805  Scramblase family protein  23.79 
 
 
213 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1964  hypothetical protein  62.5 
 
 
218 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2030  hypothetical protein  62.5 
 
 
218 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67659  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1984  hypothetical protein  62.5 
 
 
218 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>