14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3893 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3893  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  226  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1984  hypothetical protein  43.59 
 
 
218 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2030  hypothetical protein  43.59 
 
 
218 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67659  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1964  hypothetical protein  43.59 
 
 
218 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0692  hypothetical protein  34.74 
 
 
200 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2440  hypothetical protein  51.28 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6231  Scramblase family protein  58.62 
 
 
279 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2679  hypothetical protein  66.67 
 
 
322 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0699  hypothetical protein  60.71 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  52.94 
 
 
560 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1443  peptidase domain protein  54.84 
 
 
442 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0305  hypothetical protein  60 
 
 
264 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0454442  normal  0.0588039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3649  hypothetical protein  51.72 
 
 
217 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0788974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03780  Protein of unknown function (DUF2510)  56 
 
 
241 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.236518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>