17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2679 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2679  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  635    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7675  hypothetical protein  45.21 
 
 
431 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1255  hypothetical protein  31.52 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3999  hypothetical protein  31.56 
 
 
594 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135545  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1443  peptidase domain protein  55.32 
 
 
442 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03780  Protein of unknown function (DUF2510)  45.45 
 
 
241 aa  49.7  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  40.91 
 
 
258 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6231  Scramblase family protein  63.33 
 
 
279 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7834  ATP/GTP binding protein  60 
 
 
664 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.675411  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  46.67 
 
 
560 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0692  hypothetical protein  69.23 
 
 
200 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3844  scramblase family protein  65.38 
 
 
329 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13517  hypothetical protein  56.41 
 
 
260 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.15754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3893  hypothetical protein  66.67 
 
 
111 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13474  transmembrane protein  68.97 
 
 
158 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000115687  hitchhiker  0.00217332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3569  hypothetical protein  40 
 
 
177 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1052  hypothetical protein  58.62 
 
 
237 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.0269502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>