18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3844 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3844  scramblase family protein  100 
 
 		 329 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6231  Scramblase family protein  62.44 
 
 		 279 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3637  Scramblase family protein  34.02 
 
 		 200 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855043  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5036  scramblase family protein  24.64 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3844  Scramblase family protein  27.23 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333635  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32210  phospholipid scramblase 1  25.62 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0648042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0805  Scramblase family protein  29.11 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02780  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 		 462 aa  49.7  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2679  hypothetical protein  57.89 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7834  ATP/GTP binding protein  58.62 
 
 		 664 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.675411  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7675  hypothetical protein  68.97 
 
 		 431 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0692  hypothetical protein  62.96 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1442  hypothetical protein  53.85 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.268865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4239  hypothetical protein  62.5 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13517  hypothetical protein  56.67 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.15754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  25.23 
 
 		 258 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2268  hypothetical protein  60.71 
 
 		 553 aa  43.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1443  peptidase domain protein  33.96 
 
 		 442 aa  42.7  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>