41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3769 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  100 
 
 		 258 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  31.49 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  28.03 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  34.29 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  29.73 
 
 		 167 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  28.57 
 
 		 151 aa  52  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  29.17 
 
 		 393 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  35.15 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  28.41 
 
 		 447 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  40.28 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  30 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  37.36 
 
 		 211 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  28.95 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  24.54 
 
 		 150 aa  46.2  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  41.89 
 
 		 511 aa  46.2  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  38.2 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  38.75 
 
 		 375 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  32.65 
 
 		 149 aa  45.8  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  29.44 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  38.37 
 
 		 375 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  39.56 
 
 		 166 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  62.96 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  38.37 
 
 		 403 aa  45.4  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  27.87 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  36.67 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  29.33 
 
 		 154 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  25.62 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2679  hypothetical protein  48.08 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  36.25 
 
 		 449 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  24 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  33.72 
 
 		 448 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  36.25 
 
 		 444 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  37.21 
 
 		 414 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  32.56 
 
 		 412 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  38.03 
 
 		 152 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  32.56 
 
 		 415 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  32.56 
 
 		 412 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  32.56 
 
 		 415 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  31.68 
 
 		 185 aa  42.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  31.78 
 
 		 198 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  30.63 
 
 		 169 aa  42  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>