16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4681 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 327 aa  627  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  84.16 
 
 		 313 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  41.7 
 
 		 276 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  31.03 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  31.52 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  29.61 
 
 		 393 aa  65.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  32.98 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  29.09 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  29.19 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  37.27 
 
 		 2914 aa  50.4  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  30.51 
 
 		 242 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  33.98 
 
 		 2397 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  26.7 
 
 		 181 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  26.69 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>