20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4251 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  85.2 
 
 		 327 aa  305  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  37.78 
 
 		 276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  29.97 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  34.64 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  31.22 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  33.51 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  34.04 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  30.2 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  40.38 
 
 		 198 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  26.92 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  27.88 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  36.36 
 
 		 2272 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  32.41 
 
 		 174 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  31.36 
 
 		 2179 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3018  RDD domain-containing protein  31.21 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.792244  normal  0.129954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2976  RDD domain-containing protein  31.21 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0648796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  26.14 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  30.36 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  34.91 
 
 		 2914 aa  42.7  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>