26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3418 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 393 aa  758    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  33.66 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  40.11 
 
 		 191 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  33.97 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  36.46 
 
 		 514 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  38.67 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  30.77 
 
 		 181 aa  53.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  30.84 
 
 		 242 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  32.46 
 
 		 327 aa  53.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  33.02 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  29.17 
 
 		 258 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  37.25 
 
 		 221 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  23.91 
 
 		 276 aa  47  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  29.11 
 
 		 174 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  27.75 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  30.5 
 
 		 185 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  26.7 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  27.63 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  28.44 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1033  RDD domain-containing protein  28 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  30.86 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  53.16 
 
 		 323 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0732  RDD domain-containing protein  31.52 
 
 		 248 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.70222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  30.3 
 
 		 211 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  41.26 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3395  RDD domain-containing protein  24.79 
 
 		 224 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>