21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  358  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  41.76 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  30.64 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  34.21 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  29.65 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  39.18 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 393 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2516  RDD domain-containing protein  28.77 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2561  RDD domain-containing protein  28.77 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.636636  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2553  RDD domain-containing protein  28.77 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594635  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.47 
 
 		 257 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  26.51 
 
 		 247 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1336  hypothetical protein  27.68 
 
 		 327 aa  47.8  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000287065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  28.66 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  41.89 
 
 		 511 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  30.21 
 
 		 149 aa  45.1  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  27.63 
 
 		 463 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  29.61 
 
 		 214 aa  44.3  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  27.03 
 
 		 327 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  29.41 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  28.91 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>