43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4558 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  43.59 
 
 		 373 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  39.45 
 
 		 198 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  54.88 
 
 		 240 aa  102  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  36.71 
 
 		 167 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  32.48 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  53.73 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  34.39 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  43.53 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  43.84 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  43.84 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  43.84 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  46.99 
 
 		 365 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  43.06 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  39.73 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  33.53 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  26.29 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  29.82 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 		 499 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30.69 
 
 		 2179 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  36.78 
 
 		 2272 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  35.51 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  27.47 
 
 		 393 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  30 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  27.22 
 
 		 668 aa  48.9  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  28.48 
 
 		 169 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3295  hypothetical protein  39.89 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  30.57 
 
 		 447 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  39.44 
 
 		 375 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  38.14 
 
 		 537 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  25.4 
 
 		 187 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  32.94 
 
 		 141 aa  44.7  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  41.38 
 
 		 166 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  35.19 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  45.78 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1410  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.94 
 
 		 447 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  29.09 
 
 		 150 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.73 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  35.44 
 
 		 511 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  28.74 
 
 		 217 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  37.89 
 
 		 1689 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>