42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9150 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  100 
 
 		 447 aa  812    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  40.34 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  44.33 
 
 		 191 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  47.4 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  28.04 
 
 		 750 aa  73.6  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  28.15 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  37.71 
 
 		 214 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  27.84 
 
 		 247 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  30.9 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  35.44 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  38.6 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  33.82 
 
 		 3242 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  32.9 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  35.09 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  31.85 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  29.21 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  30.91 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  23.95 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  32.18 
 
 		 276 aa  57  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  36 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  29.52 
 
 		 310 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  31.93 
 
 		 175 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  28 
 
 		 258 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  23.95 
 
 		 135 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  25.19 
 
 		 1116 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  21.93 
 
 		 680 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.64 
 
 		 751 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  31.06 
 
 		 174 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  45.79 
 
 		 207 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  24.42 
 
 		 567 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3251  hypothetical protein  33.96 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000386077  hitchhiker  0.0000104136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  38.95 
 
 		 194 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3381  hypothetical protein  26.94 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0522  RNA-binding S4 domain protein  20.9 
 
 		 698 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575781 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04595  An-Nup2 Nuclear pore complex protein (Eurofung)  31.71 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  48.09 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04670  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 		 2094 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  31.36 
 
 		 276 aa  44.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5978  hypothetical protein  45.16 
 
 		 305 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128515  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0477  RNA-binding S4 domain protein  20.6 
 
 		 689 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53583  normal  0.544761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3766  hypothetical protein  43.53 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  30.36 
 
 		 158 aa  43.5  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>