20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5978 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5978  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  570  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128515  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0653  antigen 34 kDa family protein  45.07 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  51.88 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0153  hypothetical protein  44.44 
 
 		 784 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40.69 
 
 		 985 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3984  hypothetical protein  33.59 
 
 		 742 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580722  hitchhiker  0.00476383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  52.22 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1443  peptidase domain protein  43.48 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  40.3 
 
 		 1131 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15396  predicted protein  39.74 
 
 		 1803 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.407971  normal  0.0726327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  37.75 
 
 		 1029 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.42 
 
 		 751 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2451  hypothetical protein  33.1 
 
 		 190 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258155  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  40.5 
 
 		 1079 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15910  hypothetical protein  44.76 
 
 		 568 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.702555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  54.21 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3766  hypothetical protein  31.1 
 
 		 412 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4422  hypothetical protein  28.21 
 
 		 409 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1401  hypothetical protein  27.27 
 
 		 631 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  47.52 
 
 		 373 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>