More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2774 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  63.32 
 
 		 686 aa  702    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  51.3 
 
 		 888 aa  679    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  44.44 
 
 		 1029 aa  758    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  60 
 
 		 720 aa  676    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  63.32 
 
 		 686 aa  702    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  58.12 
 
 		 711 aa  642    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  62.8 
 
 		 686 aa  698    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  63.15 
 
 		 686 aa  701    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  63.15 
 
 		 686 aa  701    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  62.78 
 
 		 739 aa  704    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  56.34 
 
 		 986 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  56.56 
 
 		 947 aa  641    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  55.88 
 
 		 752 aa  642    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  59.07 
 
 		 705 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  62.98 
 
 		 688 aa  699    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  62.8 
 
 		 686 aa  698    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  61.25 
 
 		 692 aa  713    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  60.38 
 
 		 903 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  62.02 
 
 		 845 aa  703    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  63.08 
 
 		 732 aa  713    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 1161 aa  805    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  61.71 
 
 		 1035 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  57.53 
 
 		 822 aa  645    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  59.07 
 
 		 705 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  62.8 
 
 		 688 aa  696    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  62.98 
 
 		 686 aa  699    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  57.47 
 
 		 860 aa  662    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  56.51 
 
 		 980 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  60.58 
 
 		 679 aa  699    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  60.68 
 
 		 679 aa  700    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  50.31 
 
 		 971 aa  921    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  57.44 
 
 		 882 aa  673    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  56.13 
 
 		 882 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  58.05 
 
 		 985 aa  859    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.86 
 
 		 921 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1131 aa  2288    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  58.45 
 
 		 686 aa  649    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  62.02 
 
 		 689 aa  704    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  56.67 
 
 		 883 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 		 1116 aa  633  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.3 
 
 		 884 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  55.84 
 
 		 673 aa  616  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  54.04 
 
 		 949 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  53.33 
 
 		 882 aa  614  9.999999999999999e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  53.67 
 
 		 907 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  54.25 
 
 		 943 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 		 920 aa  604  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  49.63 
 
 		 950 aa  604  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 		 1042 aa  600  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  55.05 
 
 		 962 aa  602  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 880 aa  599  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  54.25 
 
 		 979 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 896 aa  594  1e-168  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  51.81 
 
 		 922 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  52.45 
 
 		 1128 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  50.55 
 
 		 880 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  50.55 
 
 		 880 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  50.55 
 
 		 880 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  49.55 
 
 		 943 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  49.7 
 
 		 943 aa  595  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  49.77 
 
 		 881 aa  595  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  50.55 
 
 		 880 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  54.33 
 
 		 964 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  54.51 
 
 		 968 aa  592  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  49.53 
 
 		 959 aa  591  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 		 885 aa  592  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  49.23 
 
 		 970 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 		 964 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 975 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  51.54 
 
 		 1038 aa  592  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 975 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  53.72 
 
 		 964 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  54.95 
 
 		 989 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  53.41 
 
 		 945 aa  590  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  53.73 
 
 		 854 aa  592  1e-167  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  52.43 
 
 		 1005 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 		 885 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 		 885 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  53.49 
 
 		 885 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 		 889 aa  591  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  50.15 
 
 		 882 aa  592  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  54.51 
 
 		 969 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 975 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 929 aa  586  1e-166  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 975 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 975 aa  588  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  54.17 
 
 		 904 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  52.35 
 
 		 1161 aa  589  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  54.25 
 
 		 966 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 975 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 848 aa  587  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  54.17 
 
 		 972 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 965 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  46.69 
 
 		 984 aa  588  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 976 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  45.42 
 
 		 964 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  54.17 
 
 		 971 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  54 
 
 		 971 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  50.49 
 
 		 834 aa  588  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  54 
 
 		 971 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>