More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1210 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  64.59 
 
 		 890 aa  778    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  64.59 
 
 		 890 aa  778    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  69.44 
 
 		 990 aa  917    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.18 
 
 		 883 aa  668    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4712  translation initiation factor IF-2  63.09 
 
 		 846 aa  792    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333126  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  58.16 
 
 		 854 aa  783    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  55.23 
 
 		 894 aa  806    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  61.56 
 
 		 895 aa  802    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  63.7 
 
 		 868 aa  786    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  91.3 
 
 		 964 aa  1487    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  59.9 
 
 		 953 aa  1029    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  63.09 
 
 		 889 aa  784    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  57.78 
 
 		 887 aa  656    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  62.62 
 
 		 882 aa  828    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  62.85 
 
 		 885 aa  822    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  64.15 
 
 		 841 aa  776    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  62.01 
 
 		 880 aa  822    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 686 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 686 aa  636    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  85.19 
 
 		 975 aa  1121    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  64.03 
 
 		 868 aa  799    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  64.03 
 
 		 868 aa  798    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4180  translation initiation factor IF-2  64.32 
 
 		 841 aa  778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  45.53 
 
 		 908 aa  783    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  67.98 
 
 		 948 aa  972    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  64.42 
 
 		 898 aa  780    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  81.59 
 
 		 966 aa  1344    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  65.73 
 
 		 922 aa  955    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  66.09 
 
 		 898 aa  788    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  62.56 
 
 		 890 aa  748    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  85.34 
 
 		 975 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  50.37 
 
 		 845 aa  818    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  63.87 
 
 		 837 aa  787    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 836 aa  636    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  57.39 
 
 		 947 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  81.74 
 
 		 972 aa  1129    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  65.39 
 
 		 920 aa  1112    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0563  translation initiation factor IF-2  65.62 
 
 		 816 aa  795    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.852622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  85.19 
 
 		 975 aa  1121    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  85.19 
 
 		 975 aa  1121    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.13 
 
 		 884 aa  666    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  52.98 
 
 		 984 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1123  translation initiation factor IF-2  60.48 
 
 		 818 aa  743    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  82.63 
 
 		 969 aa  1112    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  63.07 
 
 		 943 aa  1094    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  62.01 
 
 		 880 aa  822    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  68.18 
 
 		 992 aa  961    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  71.41 
 
 		 876 aa  935    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 		 873 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  57.72 
 
 		 903 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  80.95 
 
 		 976 aa  1125    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  85.19 
 
 		 975 aa  1121    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  57.4 
 
 		 905 aa  724    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  54.48 
 
 		 689 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  66.72 
 
 		 837 aa  803    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  62.25 
 
 		 978 aa  1066    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2708  translation initiation factor IF-2  60.49 
 
 		 908 aa  728    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.334172  normal  0.377403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  64.59 
 
 		 890 aa  778    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  59.14 
 
 		 907 aa  1066    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  62.5 
 
 		 968 aa  1082    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  82.8 
 
 		 989 aa  1110    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  62.79 
 
 		 884 aa  819    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  62.01 
 
 		 880 aa  822    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  64.67 
 
 		 843 aa  792    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  62.48 
 
 		 880 aa  826    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  45.43 
 
 		 908 aa  782    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  78.19 
 
 		 979 aa  1400    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  57.34 
 
 		 880 aa  719    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  63.57 
 
 		 885 aa  831    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 835 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  50.15 
 
 		 836 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  82.37 
 
 		 971 aa  1132    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  49.79 
 
 		 882 aa  670    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  63.3 
 
 		 869 aa  781    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  56.4 
 
 		 856 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  64.59 
 
 		 890 aa  778    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 887 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  55.73 
 
 		 892 aa  788    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  63.35 
 
 		 831 aa  804    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  61.5 
 
 		 943 aa  1075    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  62.7 
 
 		 885 aa  820    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  62.7 
 
 		 885 aa  820    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  53.91 
 
 		 883 aa  676    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  61.7 
 
 		 881 aa  816    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  50.89 
 
 		 882 aa  645    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4577  translation initiation factor IF-2  63.09 
 
 		 846 aa  792    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  82.39 
 
 		 971 aa  1120    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  66.72 
 
 		 840 aa  802    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 1079 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  61.6 
 
 		 848 aa  756    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  50.22 
 
 		 985 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  66.29 
 
 		 828 aa  814    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  48.65 
 
 		 880 aa  848    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  82.37 
 
 		 971 aa  1132    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 962 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  54.87 
 
 		 949 aa  674    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  85.34 
 
 		 975 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  85.34 
 
 		 975 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 		 921 aa  661    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1600  translation initiation factor IF-2  66.61 
 
 		 803 aa  793    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>