More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0069 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  60.97 
 
 		 890 aa  725    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  60.97 
 
 		 890 aa  725    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  53.81 
 
 		 953 aa  695    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  60.97 
 
 		 890 aa  725    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4712  translation initiation factor IF-2  61.85 
 
 		 846 aa  746    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333126  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  56.59 
 
 		 948 aa  702    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  56.96 
 
 		 880 aa  764    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  61.32 
 
 		 868 aa  718    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  55.95 
 
 		 964 aa  717    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  60.97 
 
 		 890 aa  725    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  57.43 
 
 		 889 aa  743    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  54.4 
 
 		 992 aa  702    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  57.02 
 
 		 964 aa  728    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  53.21 
 
 		 943 aa  687    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  56.79 
 
 		 885 aa  760    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  61.11 
 
 		 841 aa  726    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01303  translation initiation factor IF-2  55.25 
 
 		 904 aa  701    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  60.97 
 
 		 890 aa  725    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  59.42 
 
 		 896 aa  746    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  57.41 
 
 		 868 aa  731    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  57.41 
 
 		 868 aa  731    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4180  translation initiation factor IF-2  61.28 
 
 		 841 aa  728    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 908 aa  1830    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 904 aa  730    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  59.1 
 
 		 848 aa  774    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  81.74 
 
 		 905 aa  1475    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  58.05 
 
 		 966 aa  713    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  55.4 
 
 		 922 aa  717    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  59.1 
 
 		 894 aa  745    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3476  translation initiation factor IF-2  61.47 
 
 		 892 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  52.67 
 
 		 845 aa  733    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  61.95 
 
 		 837 aa  731    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3475  translation initiation factor IF-2  61.47 
 
 		 892 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  56.45 
 
 		 972 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  58.45 
 
 		 972 aa  723    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0179  translation initiation factor IF-2  54.91 
 
 		 892 aa  692    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.61877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  58.94 
 
 		 895 aa  752    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  52.2 
 
 		 990 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  57.1 
 
 		 880 aa  766    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2815  translation initiation factor IF-2  56.51 
 
 		 883 aa  691    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1600  translation initiation factor IF-2  58.83 
 
 		 803 aa  708    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1123  translation initiation factor IF-2  57.03 
 
 		 818 aa  696    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0563  translation initiation factor IF-2  59.67 
 
 		 816 aa  707    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.852622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  49.95 
 
 		 898 aa  773    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  61.47 
 
 		 892 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  55.01 
 
 		 875 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  54.95 
 
 		 876 aa  712    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  56.96 
 
 		 880 aa  764    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  58 
 
 		 968 aa  728    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  56.96 
 
 		 880 aa  764    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  60.8 
 
 		 890 aa  723    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  60 
 
 		 896 aa  736    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  58.45 
 
 		 971 aa  725    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  55.66 
 
 		 978 aa  686    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  55.81 
 
 		 892 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  46.02 
 
 		 907 aa  779    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  54.16 
 
 		 968 aa  694    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  57.98 
 
 		 884 aa  743    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  55.8 
 
 		 917 aa  690    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  61.68 
 
 		 843 aa  754    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  56.93 
 
 		 991 aa  701    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  98.68 
 
 		 908 aa  1811    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  44.66 
 
 		 880 aa  712    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  60.81 
 
 		 885 aa  764    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 835 aa  636    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3643  translation initiation factor IF-2  61.47 
 
 		 892 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  58.45 
 
 		 971 aa  725    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  57.14 
 
 		 920 aa  705    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  60.85 
 
 		 869 aa  746    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  60.97 
 
 		 890 aa  725    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  55.81 
 
 		 892 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  61.01 
 
 		 837 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  48.05 
 
 		 854 aa  795    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 		 831 aa  723    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  48.56 
 
 		 894 aa  784    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  56.79 
 
 		 885 aa  759    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  56.79 
 
 		 885 aa  759    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  58.35 
 
 		 883 aa  722    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  55.27 
 
 		 881 aa  750    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  56.96 
 
 		 880 aa  764    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  56.29 
 
 		 969 aa  724    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  56.45 
 
 		 971 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  61.01 
 
 		 840 aa  723    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  53.17 
 
 		 943 aa  702    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  58.25 
 
 		 965 aa  721    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  55.01 
 
 		 875 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  48.64 
 
 		 891 aa  788    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  61.47 
 
 		 892 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  48.31 
 
 		 880 aa  790    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  58.45 
 
 		 971 aa  725    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  60.97 
 
 		 890 aa  725    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  59.9 
 
 		 853 aa  760    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  56.94 
 
 		 889 aa  762    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0203  translation initiation factor IF-2  54.91 
 
 		 892 aa  690    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.665385  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  60.4 
 
 		 898 aa  737    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  50.54 
 
 		 884 aa  790    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  57.67 
 
 		 890 aa  686    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  61.15 
 
 		 868 aa  741    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  53.21 
 
 		 943 aa  687    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  60.13 
 
 		 882 aa  763    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>