More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1315 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  53.05 
 
 		 890 aa  870    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  53.05 
 
 		 890 aa  870    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  62.12 
 
 		 828 aa  803    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.42 
 
 		 883 aa  651    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0179  translation initiation factor IF-2  50.99 
 
 		 892 aa  850    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.61877  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  53.15 
 
 		 892 aa  863    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  53.05 
 
 		 890 aa  870    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 868 aa  1737    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  60.88 
 
 		 964 aa  788    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 854 aa  885    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  62.7 
 
 		 889 aa  796    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  63.11 
 
 		 991 aa  753    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  59.77 
 
 		 885 aa  826    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  47.38 
 
 		 959 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  64.89 
 
 		 885 aa  820    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  52.64 
 
 		 841 aa  831    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  60.64 
 
 		 905 aa  724    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  47.07 
 
 		 964 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  62.29 
 
 		 880 aa  815    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  65.65 
 
 		 975 aa  799    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  51.29 
 
 		 868 aa  856    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 		 868 aa  855    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4180  translation initiation factor IF-2  64.36 
 
 		 841 aa  766    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  48.04 
 
 		 908 aa  763    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  60.34 
 
 		 943 aa  774    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  61.66 
 
 		 920 aa  743    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  64.25 
 
 		 966 aa  773    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  54.49 
 
 		 922 aa  771    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0721  translation initiation factor IF-2  65.82 
 
 		 843 aa  791    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467302  normal  0.0872602 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  65.48 
 
 		 975 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  59.32 
 
 		 845 aa  969    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  52.57 
 
 		 837 aa  850    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  51.64 
 
 		 836 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 		 947 aa  642    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  65.93 
 
 		 972 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  62.37 
 
 		 943 aa  751    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  65.48 
 
 		 975 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  51.79 
 
 		 836 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  65.65 
 
 		 975 aa  799    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.16 
 
 		 884 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  61.05 
 
 		 917 aa  734    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  56.96 
 
 		 896 aa  805    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  65.65 
 
 		 975 aa  799    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  61.16 
 
 		 990 aa  740    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  51.3 
 
 		 876 aa  808    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  66.1 
 
 		 972 aa  799    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  50.14 
 
 		 903 aa  644    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  64.81 
 
 		 976 aa  791    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  65.65 
 
 		 975 aa  799    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  65.89 
 
 		 837 aa  793    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  65.59 
 
 		 969 aa  798    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  53.05 
 
 		 890 aa  870    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  62.41 
 
 		 978 aa  727    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2708  translation initiation factor IF-2  64.56 
 
 		 908 aa  781    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.334172  normal  0.377403 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0563  translation initiation factor IF-2  61.52 
 
 		 816 aa  790    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.852622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  61.59 
 
 		 968 aa  755    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  63.7 
 
 		 989 aa  788    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  60.59 
 
 		 884 aa  797    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  54.11 
 
 		 894 aa  905    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  61.17 
 
 		 843 aa  813    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  66.1 
 
 		 971 aa  799    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  47.83 
 
 		 908 aa  759    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  48.61 
 
 		 880 aa  781    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  62.75 
 
 		 880 aa  817    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  64.75 
 
 		 965 aa  786    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  66.1 
 
 		 971 aa  800    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  54.46 
 
 		 898 aa  881    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  53.42 
 
 		 869 aa  865    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1600  translation initiation factor IF-2  61.67 
 
 		 803 aa  791    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215539  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  53.53 
 
 		 884 aa  868    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  64.86 
 
 		 896 aa  807    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  52.57 
 
 		 895 aa  879    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  53.51 
 
 		 831 aa  792    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  65.05 
 
 		 885 aa  823    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  65.05 
 
 		 885 aa  823    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  67.23 
 
 		 883 aa  828    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  60.96 
 
 		 881 aa  803    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  53.15 
 
 		 892 aa  863    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  62.29 
 
 		 880 aa  815    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  65.93 
 
 		 971 aa  799    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  65.89 
 
 		 840 aa  792    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  62.59 
 
 		 953 aa  746    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  56.13 
 
 		 882 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  52.25 
 
 		 898 aa  867    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  62.71 
 
 		 948 aa  758    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  53.05 
 
 		 890 aa  870    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  66.1 
 
 		 971 aa  800    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  53.05 
 
 		 890 aa  870    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  47.66 
 
 		 949 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  64.89 
 
 		 889 aa  822    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  47.38 
 
 		 990 aa  644    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  62.29 
 
 		 880 aa  815    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 		 921 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  60.45 
 
 		 992 aa  748    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0203  translation initiation factor IF-2  50.88 
 
 		 892 aa  850    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.665385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  65.48 
 
 		 975 aa  797    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  64.94 
 
 		 882 aa  828    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  52.99 
 
 		 880 aa  863    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  66.38 
 
 		 890 aa  800    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  60.51 
 
 		 848 aa  811    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>