More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0067 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  64.48 
 
 
890 aa  796    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  64.48 
 
 
890 aa  796    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 
848 aa  648    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  58.45 
 
 
883 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  55.75 
 
 
979 aa  644    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  54.42 
 
 
896 aa  644    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 
720 aa  645    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  73.51 
 
 
964 aa  954    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  56.25 
 
 
686 aa  660    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  57.77 
 
 
889 aa  773    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  59.86 
 
 
885 aa  842    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  50.63 
 
 
985 aa  664    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  56.12 
 
 
959 aa  666    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  60.4 
 
 
885 aa  840    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  56.08 
 
 
686 aa  657    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  56.25 
 
 
686 aa  659    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  56.25 
 
 
686 aa  659    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  62.98 
 
 
868 aa  799    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  46.24 
 
 
908 aa  782    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  67.65 
 
 
904 aa  974    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  59.05 
 
 
880 aa  847    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  52.28 
 
 
838 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  69.84 
 
 
966 aa  949    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  64.01 
 
 
922 aa  1072    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 
871 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  60.67 
 
 
880 aa  845    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  58.19 
 
 
845 aa  808    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  52.76 
 
 
836 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  43.3 
 
 
947 aa  689    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  69.77 
 
 
972 aa  950    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  60.67 
 
 
880 aa  845    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  65.13 
 
 
990 aa  858    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 
705 aa  643    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  75.31 
 
 
975 aa  967    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.34 
 
 
884 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  52.46 
 
 
984 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1123  translation initiation factor IF-2  60.82 
 
 
818 aa  728    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  56.08 
 
 
686 aa  657    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  64.91 
 
 
943 aa  896    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  48.78 
 
 
956 aa  637    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  50.27 
 
 
898 aa  839    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  54.34 
 
 
873 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  56.22 
 
 
903 aa  670    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  70.28 
 
 
976 aa  966    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 
905 aa  747    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 
886 aa  641    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 
1083 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  50.53 
 
 
824 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2708  translation initiation factor IF-2  61.37 
 
 
908 aa  733    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.334172  normal  0.377403 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  100 
 
 
907 aa  1818    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  68.86 
 
 
968 aa  885    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  74.17 
 
 
989 aa  958    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  60.33 
 
 
884 aa  824    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 
883 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  61.91 
 
 
843 aa  778    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 
868 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  47.14 
 
 
908 aa  786    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  69.83 
 
 
979 aa  961    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  59.02 
 
 
880 aa  733    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  56.12 
 
 
990 aa  663    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  53.54 
 
 
835 aa  674    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  69.67 
 
 
971 aa  956    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 
705 aa  643    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  56.25 
 
 
869 aa  768    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  55.95 
 
 
856 aa  668    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  50.46 
 
 
1008 aa  640    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  55.44 
 
 
887 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  57.52 
 
 
892 aa  801    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  65.21 
 
 
831 aa  799    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  60.51 
 
 
898 aa  805    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  59.8 
 
 
885 aa  845    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  59.8 
 
 
885 aa  845    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  62.75 
 
 
883 aa  790    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  52.19 
 
 
881 aa  890    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  53.2 
 
 
882 aa  637    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0563  translation initiation factor IF-2  65.05 
 
 
816 aa  785    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.852622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  73.58 
 
 
971 aa  950    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  56.86 
 
 
882 aa  689    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  62.13 
 
 
854 aa  788    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  50.15 
 
 
856 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  51.67 
 
 
885 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  68.74 
 
 
920 aa  914    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  53.27 
 
 
921 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  69.67 
 
 
971 aa  956    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  51.91 
 
 
962 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  52.22 
 
 
949 aa  709    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  60.55 
 
 
889 aa  846    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  55.44 
 
 
964 aa  663    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  52.91 
 
 
836 aa  656    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  56.23 
 
 
921 aa  694    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 
689 aa  670    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  52.94 
 
 
848 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  56.82 
 
 
887 aa  664    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  61.86 
 
 
882 aa  839    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  50.71 
 
 
880 aa  836    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  61.34 
 
 
890 aa  755    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  60.86 
 
 
848 aa  766    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 
1079 aa  664    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  64.46 
 
 
943 aa  890    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  69.59 
 
 
992 aa  893    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>