More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0900 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  59.66 
 
 		 688 aa  717    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  57.76 
 
 		 1161 aa  697    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  52.4 
 
 		 885 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.84 
 
 		 883 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  54.82 
 
 		 892 aa  662    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  52.08 
 
 		 752 aa  648    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  53.91 
 
 		 896 aa  655    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  59.15 
 
 		 720 aa  705    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  55.19 
 
 		 964 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  58.76 
 
 		 686 aa  721    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  41.53 
 
 		 927 aa  651    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  58.26 
 
 		 686 aa  717    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  58.6 
 
 		 686 aa  719    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  58.6 
 
 		 686 aa  719    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  57.78 
 
 		 705 aa  677    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  58.5 
 
 		 689 aa  719    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  53.67 
 
 		 711 aa  643    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  59.39 
 
 		 732 aa  738    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  50.82 
 
 		 882 aa  702    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 		 947 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  52.4 
 
 		 895 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  45.66 
 
 		 985 aa  770    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  54.93 
 
 		 894 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  45.14 
 
 		 884 aa  706    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  58.26 
 
 		 686 aa  717    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  53.22 
 
 		 964 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  56.21 
 
 		 673 aa  666    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  48.75 
 
 		 903 aa  803    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 976 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  60 
 
 		 688 aa  717    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 		 949 aa  686    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  53.2 
 
 		 907 aa  638    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 		 989 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  52.74 
 
 		 979 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  55.94 
 
 		 898 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  60 
 
 		 1029 aa  736    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  57.47 
 
 		 971 aa  770    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  57.78 
 
 		 705 aa  677    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  57.72 
 
 		 679 aa  687    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  57.88 
 
 		 679 aa  687    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  59.83 
 
 		 686 aa  719    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  57.34 
 
 		 997 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.17 
 
 		 822 aa  699    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  59.63 
 
 		 739 aa  734    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 882 aa  1797    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  41.48 
 
 		 882 aa  655    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  46.26 
 
 		 860 aa  717    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  53.22 
 
 		 964 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  56.33 
 
 		 962 aa  662    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  56.44 
 
 		 980 aa  696    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  57.44 
 
 		 1131 aa  661    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  59.75 
 
 		 1035 aa  655    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  61.79 
 
 		 686 aa  706    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  56.67 
 
 		 986 aa  696    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  58.76 
 
 		 686 aa  721    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  62.43 
 
 		 692 aa  728    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  55.09 
 
 		 1079 aa  653    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 888 aa  716    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  60.37 
 
 		 845 aa  689    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  53.54 
 
 		 922 aa  634  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  42.51 
 
 		 882 aa  632  1e-180  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  54.33 
 
 		 971 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  54.33 
 
 		 971 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  52.95 
 
 		 896 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  53.86 
 
 		 1116 aa  635  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 971 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 1079 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  54.33 
 
 		 971 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  52.74 
 
 		 949 aa  634  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 969 aa  631  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 986 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 		 904 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 972 aa  632  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 		 884 aa  631  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  53.32 
 
 		 880 aa  630  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  55.1 
 
 		 902 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  52.48 
 
 		 894 aa  630  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  53.68 
 
 		 891 aa  631  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  53.95 
 
 		 965 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  53.68 
 
 		 889 aa  625  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  49.63 
 
 		 940 aa  628  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  53.29 
 
 		 968 aa  629  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  54 
 
 		 972 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 		 885 aa  625  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  55.11 
 
 		 898 aa  623  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  55.17 
 
 		 854 aa  624  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  52.98 
 
 		 880 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  52.98 
 
 		 880 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 884 aa  625  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 		 875 aa  625  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 896 aa  625  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 		 889 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  52.34 
 
 		 882 aa  625  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>