More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0225 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  56.23 
 
 		 990 aa  753    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  56.72 
 
 		 989 aa  759    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.13 
 
 		 883 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  59.14 
 
 		 885 aa  785    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  44.64 
 
 		 894 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  59.28 
 
 		 887 aa  771    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  51.12 
 
 		 921 aa  788    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  57.78 
 
 		 971 aa  747    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  57.71 
 
 		 975 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  58.46 
 
 		 964 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  56.32 
 
 		 1045 aa  748    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  57.88 
 
 		 975 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  48.96 
 
 		 848 aa  776    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  56.38 
 
 		 912 aa  640    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  54.63 
 
 		 856 aa  698    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  51.94 
 
 		 883 aa  755    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  51.41 
 
 		 980 aa  663    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  55.17 
 
 		 732 aa  640    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  57.71 
 
 		 975 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  57.78 
 
 		 964 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  56.51 
 
 		 904 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2070  translation initiation factor IF-2  71.43 
 
 		 907 aa  1095    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  60.15 
 
 		 981 aa  756    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  57.44 
 
 		 966 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  58.1 
 
 		 922 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  59.1 
 
 		 871 aa  751    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  56.34 
 
 		 875 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  57.88 
 
 		 975 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  46.99 
 
 		 845 aa  648    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  56.57 
 
 		 1083 aa  780    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  58.58 
 
 		 836 aa  749    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.84 
 
 		 947 aa  646    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  56.85 
 
 		 972 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  57.07 
 
 		 845 aa  655    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  55.77 
 
 		 884 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  59.61 
 
 		 917 aa  770    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  58.58 
 
 		 838 aa  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  56.55 
 
 		 969 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  56.85 
 
 		 971 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  57.44 
 
 		 876 aa  648    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  55.36 
 
 		 873 aa  881    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  54.98 
 
 		 903 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  57.88 
 
 		 976 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  57.88 
 
 		 975 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  51.41 
 
 		 886 aa  749    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  54.32 
 
 		 875 aa  677    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 		 965 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  59.52 
 
 		 824 aa  744    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  55.39 
 
 		 972 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  51.75 
 
 		 880 aa  772    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  56.72 
 
 		 907 aa  673    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  57.3 
 
 		 975 aa  753    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  57.46 
 
 		 989 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  50.94 
 
 		 883 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  55.91 
 
 		 1053 aa  769    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  58.89 
 
 		 868 aa  754    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  57.09 
 
 		 979 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  60.21 
 
 		 832 aa  774    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 926 aa  790    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  58.72 
 
 		 835 aa  765    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  54.32 
 
 		 845 aa  666    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  56.85 
 
 		 971 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  50.22 
 
 		 985 aa  636    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  56.72 
 
 		 989 aa  759    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  60.62 
 
 		 856 aa  756    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 887 aa  1736    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  54.39 
 
 		 964 aa  797    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  57.95 
 
 		 964 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  55.79 
 
 		 895 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  56.34 
 
 		 875 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  56.09 
 
 		 986 aa  663    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  46.56 
 
 		 968 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  55.17 
 
 		 881 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  50.38 
 
 		 917 aa  770    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  57.74 
 
 		 861 aa  767    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  57.71 
 
 		 975 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 886 aa  804    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  58.73 
 
 		 836 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  57.71 
 
 		 975 aa  653    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  56.8 
 
 		 853 aa  656    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  56.85 
 
 		 971 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  56.13 
 
 		 739 aa  646    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  58.29 
 
 		 949 aa  691    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  47.23 
 
 		 884 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  50.71 
 
 		 1029 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  48.07 
 
 		 921 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  44.53 
 
 		 882 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 		 848 aa  768    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  55.84 
 
 		 882 aa  646    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 		 986 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 888 aa  634  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  56.9 
 
 		 901 aa  634  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  55.59 
 
 		 898 aa  632  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  54.91 
 
 		 971 aa  634  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  56.26 
 
 		 984 aa  634  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  58.15 
 
 		 860 aa  634  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  54.14 
 
 		 885 aa  635  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  54.21 
 
 		 822 aa  632  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 		 889 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 920 aa  632  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>