More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3727 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  56.54 
 
 		 890 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  56.54 
 
 		 890 aa  669    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  52.02 
 
 		 880 aa  661    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  57.26 
 
 		 883 aa  705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4712  translation initiation factor IF-2  55.35 
 
 		 846 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333126  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  55.88 
 
 		 838 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 		 887 aa  670    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 720 aa  640    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  52.43 
 
 		 837 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  55.19 
 
 		 964 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  55.73 
 
 		 686 aa  663    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  50.45 
 
 		 889 aa  666    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 836 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 		 985 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  45.44 
 
 		 959 aa  677    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  54.47 
 
 		 885 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 686 aa  661    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 686 aa  660    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 686 aa  660    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  55.16 
 
 		 975 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 868 aa  686    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  54.24 
 
 		 868 aa  688    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 		 832 aa  642    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  49.45 
 
 		 904 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  55.94 
 
 		 948 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  57 
 
 		 966 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  49.88 
 
 		 922 aa  701    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0563  translation initiation factor IF-2  57.84 
 
 		 816 aa  667    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.852622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  55.16 
 
 		 975 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.99 
 
 		 975 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 		 845 aa  687    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 836 aa  656    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  53.79 
 
 		 947 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  55.32 
 
 		 972 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  52.18 
 
 		 880 aa  663    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  57 
 
 		 882 aa  699    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.19 
 
 		 884 aa  700    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 984 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1123  translation initiation factor IF-2  54.11 
 
 		 818 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 686 aa  661    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  50.94 
 
 		 848 aa  649    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4577  translation initiation factor IF-2  55.35 
 
 		 846 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 		 876 aa  663    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  56.27 
 
 		 873 aa  704    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  53.39 
 
 		 903 aa  661    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  55.32 
 
 		 976 aa  675    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  52.02 
 
 		 880 aa  661    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  54.21 
 
 		 895 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  49.86 
 
 		 892 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  54.73 
 
 		 896 aa  669    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  51.94 
 
 		 978 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 705 aa  647    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  53.62 
 
 		 880 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  49.45 
 
 		 907 aa  720    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  54.6 
 
 		 968 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  55.17 
 
 		 989 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  54.41 
 
 		 884 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  55.29 
 
 		 894 aa  669    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  57.31 
 
 		 843 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  56.54 
 
 		 890 aa  669    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  56.29 
 
 		 979 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  56.54 
 
 		 890 aa  669    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 856 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 835 aa  642    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  55.25 
 
 		 921 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 971 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  55.07 
 
 		 890 aa  655    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  53.88 
 
 		 869 aa  663    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  55.95 
 
 		 953 aa  666    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  56.83 
 
 		 898 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  45.33 
 
 		 990 aa  677    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 705 aa  647    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  55.41 
 
 		 831 aa  640    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  55.16 
 
 		 975 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  55.3 
 
 		 943 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  55.93 
 
 		 883 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  48.38 
 
 		 881 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  52.55 
 
 		 882 aa  637    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 1083 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  55.27 
 
 		 971 aa  673    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  55.12 
 
 		 840 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 		 992 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.99 
 
 		 975 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  52.02 
 
 		 880 aa  661    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  53.58 
 
 		 854 aa  662    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  55.33 
 
 		 920 aa  651    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 885 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 971 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  52.5 
 
 		 962 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  100 
 
 		 949 aa  1904    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 		 889 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  54.46 
 
 		 689 aa  671    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  55.16 
 
 		 975 aa  675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.8 
 
 		 921 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  58.29 
 
 		 887 aa  684    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  56.22 
 
 		 848 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.99 
 
 		 975 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  53.88 
 
 		 880 aa  684    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  56.9 
 
 		 943 aa  664    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 		 1079 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>