More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3851 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  49.78 
 
 
895 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 
883 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  57.29 
 
 
941 aa  640    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  61.79 
 
 
971 aa  775    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  64.86 
 
 
720 aa  951    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  55.84 
 
 
1161 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 
943 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
686 aa  1386    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  48.37 
 
 
668 aa  650    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  65.76 
 
 
927 aa  786    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  99.27 
 
 
686 aa  1379    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  98.98 
 
 
686 aa  1377    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  99.42 
 
 
686 aa  1380    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  54.57 
 
 
1042 aa  644    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  99.42 
 
 
686 aa  1380    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  55.73 
 
 
964 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  57.69 
 
 
1079 aa  649    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  70.49 
 
 
732 aa  1015    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  56.31 
 
 
997 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  59.51 
 
 
920 aa  687    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 
922 aa  640    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  54.14 
 
 
1038 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  60.54 
 
 
1029 aa  758    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  64.68 
 
 
860 aa  786    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  56.22 
 
 
924 aa  657    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  57.88 
 
 
947 aa  687    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  57.52 
 
 
888 aa  732    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  53.76 
 
 
686 aa  714    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  95.64 
 
 
688 aa  1274    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  61.46 
 
 
845 aa  721    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  96.66 
 
 
688 aa  1286    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.58 
 
 
884 aa  700    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  59.27 
 
 
984 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  98.98 
 
 
686 aa  1377    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  50.23 
 
 
880 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  55.67 
 
 
1128 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 
1030 aa  649    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  56.51 
 
 
882 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  73.72 
 
 
705 aa  884    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  53.05 
 
 
894 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  58.73 
 
 
903 aa  760    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3825  translation initiation factor IF-2  99.53 
 
 
430 aa  863    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.29796e-61 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  55.33 
 
 
1126 aa  635    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  60.52 
 
 
1161 aa  725    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  56.23 
 
 
949 aa  668    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  54.1 
 
 
907 aa  663    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  55.76 
 
 
1005 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 
892 aa  662    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  56.77 
 
 
692 aa  770    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  99.85 
 
 
686 aa  1384    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.73 
 
 
979 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  50.23 
 
 
880 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  50.23 
 
 
880 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  53.76 
 
 
673 aa  716    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  50.29 
 
 
689 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  73.72 
 
 
705 aa  884    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  55.73 
 
 
964 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  56.01 
 
 
1114 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  55.8 
 
 
679 aa  726    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  55.8 
 
 
679 aa  726    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  52.28 
 
 
1059 aa  647    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  60.35 
 
 
1131 aa  705    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  54.59 
 
 
984 aa  636    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  58.76 
 
 
882 aa  731    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 
936 aa  644    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  50.23 
 
 
880 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  59.87 
 
 
950 aa  732    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  57.95 
 
 
829 aa  683    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  60.4 
 
 
882 aa  750    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  58.49 
 
 
834 aa  726    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  65.25 
 
 
943 aa  777    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  53.67 
 
 
752 aa  776    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  56.67 
 
 
986 aa  696    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  56.84 
 
 
980 aa  696    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  53.67 
 
 
949 aa  666    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  56.82 
 
 
898 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  63.58 
 
 
985 aa  773    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.15 
 
 
921 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 
991 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  57.14 
 
 
822 aa  717    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 
711 aa  640    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  61.5 
 
 
1035 aa  678    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  95.07 
 
 
689 aa  1265    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  58.38 
 
 
1079 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  52.5 
 
 
943 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  54.92 
 
 
879 aa  647    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 
1113 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 
885 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 
891 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  50.23 
 
 
880 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  53.39 
 
 
943 aa  634  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 
952 aa  635  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  51.57 
 
 
885 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  51.57 
 
 
885 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  50.31 
 
 
889 aa  632  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51.57 
 
 
885 aa  631  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  47.31 
 
 
658 aa  629  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  50.79 
 
 
884 aa  629  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 
885 aa  630  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.41 
 
 
889 aa  631  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>