More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3816 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  52.79 
 
 		 971 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  53.24 
 
 		 990 aa  683    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  45.64 
 
 		 848 aa  723    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  48.77 
 
 		 959 aa  728    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  55.92 
 
 		 1045 aa  706    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  54.46 
 
 		 917 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  54.66 
 
 		 981 aa  693    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  56.38 
 
 		 871 aa  694    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  53.39 
 
 		 989 aa  689    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  46.3 
 
 		 917 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  55.32 
 
 		 1053 aa  697    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  57.7 
 
 		 836 aa  739    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  53.39 
 
 		 989 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 856 aa  1693    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  48.83 
 
 		 964 aa  721    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  50.96 
 
 		 926 aa  710    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  55.12 
 
 		 873 aa  737    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  59.29 
 
 		 832 aa  742    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 975 aa  693    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  47.82 
 
 		 886 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  71.36 
 
 		 875 aa  926    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  51.43 
 
 		 848 aa  750    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  56.86 
 
 		 824 aa  717    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  54.63 
 
 		 880 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  45.35 
 
 		 907 aa  667    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  48.19 
 
 		 883 aa  709    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 		 883 aa  715    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  55.84 
 
 		 868 aa  689    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  58.37 
 
 		 887 aa  737    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2070  translation initiation factor IF-2  55.43 
 
 		 907 aa  668    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  55.9 
 
 		 835 aa  734    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  71.88 
 
 		 845 aa  945    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  48.62 
 
 		 856 aa  702    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  54.48 
 
 		 887 aa  683    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  54.36 
 
 		 885 aa  722    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  58.16 
 
 		 838 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  54.98 
 
 		 861 aa  691    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  50.28 
 
 		 886 aa  746    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  48.65 
 
 		 990 aa  726    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  54.73 
 
 		 949 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  57.85 
 
 		 836 aa  740    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  52.8 
 
 		 1083 aa  715    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  55.06 
 
 		 885 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 853 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  43.58 
 
 		 922 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 		 948 aa  630  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 		 984 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  48.06 
 
 		 881 aa  629  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  54.11 
 
 		 897 aa  627  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  45.16 
 
 		 884 aa  625  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 		 943 aa  627  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  53.34 
 
 		 895 aa  629  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  47.64 
 
 		 896 aa  625  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  53.68 
 
 		 885 aa  623  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  53.22 
 
 		 943 aa  624  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  54.2 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 		 875 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  53.49 
 
 		 992 aa  625  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  52.92 
 
 		 943 aa  625  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 		 875 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  53.78 
 
 		 894 aa  625  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  53.68 
 
 		 889 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 890 aa  621  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 890 aa  621  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.31 
 
 		 883 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 882 aa  621  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3475  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 		 892 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 880 aa  621  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 880 aa  621  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 880 aa  621  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  52.94 
 
 		 953 aa  621  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  53.26 
 
 		 896 aa  622  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  54.03 
 
 		 890 aa  621  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 		 892 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 890 aa  621  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 890 aa  621  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 890 aa  621  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0585  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 899 aa  620  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 		 892 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3643  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 		 892 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  53.75 
 
 		 880 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  53.68 
 
 		 885 aa  622  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  53.68 
 
 		 885 aa  622  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 890 aa  621  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 880 aa  621  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 890 aa  621  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3476  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 		 892 aa  619  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  53.99 
 
 		 991 aa  617  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  44.76 
 
 		 854 aa  618  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  49.09 
 
 		 904 aa  617  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 		 901 aa  618  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0808  translation initiation factor IF-2  46.1 
 
 		 900 aa  619  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.925902  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  46.38 
 
 		 831 aa  618  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 884 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 920 aa  615  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3465  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 905 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  44.29 
 
 		 898 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  45.84 
 
 		 894 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>