More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2452 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  63.38 
 
 		 890 aa  749    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  63.38 
 
 		 890 aa  749    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  60.32 
 
 		 885 aa  815    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  57.78 
 
 		 883 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1600  translation initiation factor IF-2  55.19 
 
 		 803 aa  764    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215539  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  63.38 
 
 		 890 aa  749    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0179  translation initiation factor IF-2  54.13 
 
 		 892 aa  685    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.61877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  77.24 
 
 		 964 aa  996    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3476  translation initiation factor IF-2  63.88 
 
 		 892 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  56.31 
 
 		 889 aa  755    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3475  translation initiation factor IF-2  63.88 
 
 		 892 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  56.27 
 
 		 882 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  56.43 
 
 		 971 aa  638    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  64.98 
 
 		 841 aa  767    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  63.88 
 
 		 892 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  76.81 
 
 		 986 aa  981    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  61.85 
 
 		 890 aa  736    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01303  translation initiation factor IF-2  56.94 
 
 		 904 aa  716    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273892  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  62.5 
 
 		 868 aa  766    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  62.5 
 
 		 868 aa  766    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4180  translation initiation factor IF-2  65.15 
 
 		 841 aa  769    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  45.51 
 
 		 908 aa  763    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 904 aa  1813    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  63.48 
 
 		 875 aa  781    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  71.94 
 
 		 968 aa  1060    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  53.96 
 
 		 887 aa  642    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  62.06 
 
 		 922 aa  1028    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4712  translation initiation factor IF-2  65.21 
 
 		 842 aa  779    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.940521  normal  0.658182 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  71.03 
 
 		 917 aa  930    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  63.77 
 
 		 837 aa  776    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 		 947 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  74.84 
 
 		 972 aa  975    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  77.13 
 
 		 965 aa  988    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  63.38 
 
 		 890 aa  749    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0563  translation initiation factor IF-2  55.19 
 
 		 816 aa  766    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.852622  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  71.35 
 
 		 920 aa  946    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  57.09 
 
 		 884 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  53.34 
 
 		 984 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1123  translation initiation factor IF-2  59.68 
 
 		 818 aa  726    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  55.95 
 
 		 949 aa  655    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0203  translation initiation factor IF-2  53.96 
 
 		 892 aa  685    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.665385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  63.38 
 
 		 890 aa  750    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  56.51 
 
 		 887 aa  636    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 873 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  54.99 
 
 		 903 aa  651    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  64.83 
 
 		 896 aa  798    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  66.88 
 
 		 990 aa  867    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  58.65 
 
 		 888 aa  652    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  63.38 
 
 		 890 aa  749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  70.78 
 
 		 978 aa  871    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2708  translation initiation factor IF-2  49.46 
 
 		 908 aa  767    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.334172  normal  0.377403 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  55.29 
 
 		 692 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  64.05 
 
 		 907 aa  1102    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  63.17 
 
 		 968 aa  881    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  62.28 
 
 		 884 aa  804    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  62.27 
 
 		 892 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  62.94 
 
 		 843 aa  755    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  63.38 
 
 		 890 aa  749    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  45.48 
 
 		 908 aa  762    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  77.05 
 
 		 979 aa  1012    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  62.27 
 
 		 892 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 835 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3643  translation initiation factor IF-2  63.88 
 
 		 892 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  49.62 
 
 		 884 aa  798    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  61.74 
 
 		 869 aa  745    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 856 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  62.58 
 
 		 891 aa  778    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0721  translation initiation factor IF-2  65.38 
 
 		 843 aa  781    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467302  normal  0.0872602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  76.59 
 
 		 964 aa  1009    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  63.51 
 
 		 831 aa  790    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  69.07 
 
 		 991 aa  888    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  62.46 
 
 		 885 aa  804    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  62.46 
 
 		 885 aa  804    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  62.08 
 
 		 883 aa  759    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  57.8 
 
 		 881 aa  813    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  54.13 
 
 		 886 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  61.54 
 
 		 894 aa  790    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  66.83 
 
 		 840 aa  790    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  63.55 
 
 		 898 aa  753    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  56.81 
 
 		 854 aa  760    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  62.05 
 
 		 895 aa  775    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  62.95 
 
 		 896 aa  798    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  63.38 
 
 		 890 aa  749    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  66.72 
 
 		 828 aa  798    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  63.48 
 
 		 875 aa  781    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  49.86 
 
 		 949 aa  669    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  62.31 
 
 		 889 aa  805    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  66.83 
 
 		 837 aa  790    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  55.04 
 
 		 986 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  57.09 
 
 		 921 aa  660    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  66.72 
 
 		 984 aa  878    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  63.76 
 
 		 898 aa  767    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  56.84 
 
 		 894 aa  781    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 		 880 aa  840    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  72.73 
 
 		 948 aa  924    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  61.2 
 
 		 848 aa  745    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  76.93 
 
 		 964 aa  1008    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  69.4 
 
 		 943 aa  892    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  70.03 
 
 		 992 aa  904    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  63.88 
 
 		 892 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>