More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0926 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  58.48 
 
 		 975 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  57.87 
 
 		 1079 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 1131 aa  681    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  58.38 
 
 		 883 aa  706    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  60.21 
 
 		 732 aa  727    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  57.99 
 
 		 720 aa  691    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  53.19 
 
 		 896 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  57.96 
 
 		 964 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  60.93 
 
 		 686 aa  731    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  57.07 
 
 		 971 aa  795    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  57.04 
 
 		 705 aa  681    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  53.99 
 
 		 936 aa  636    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  53.13 
 
 		 885 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  57.89 
 
 		 1079 aa  664    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  60.76 
 
 		 686 aa  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  61.1 
 
 		 686 aa  731    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  61.1 
 
 		 686 aa  731    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  58.3 
 
 		 975 aa  661    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  54.33 
 
 		 738 aa  638    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 888 aa  1762    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  59.56 
 
 		 689 aa  728    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  64 
 
 		 692 aa  757    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  59.07 
 
 		 904 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  60.24 
 
 		 688 aa  723    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  56.22 
 
 		 997 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  59.34 
 
 		 966 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  55.96 
 
 		 922 aa  665    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  58.3 
 
 		 964 aa  666    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  61.58 
 
 		 1161 aa  759    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  58.48 
 
 		 975 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  59.83 
 
 		 686 aa  718    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  56.4 
 
 		 992 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  58.48 
 
 		 975 aa  662    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  44.34 
 
 		 947 aa  684    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  57.79 
 
 		 972 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  58.13 
 
 		 965 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  56.78 
 
 		 1005 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  57.43 
 
 		 986 aa  704    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  45.06 
 
 		 884 aa  720    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  52.4 
 
 		 984 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  60.76 
 
 		 686 aa  729    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  56.06 
 
 		 984 aa  648    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  58.3 
 
 		 964 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  56.87 
 
 		 876 aa  641    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  58.13 
 
 		 968 aa  663    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  51.02 
 
 		 903 aa  804    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  58.13 
 
 		 976 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  51.17 
 
 		 985 aa  848    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  58.3 
 
 		 975 aa  661    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  61.58 
 
 		 739 aa  733    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  57.34 
 
 		 907 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  58.48 
 
 		 989 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  56.98 
 
 		 1029 aa  840    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  57.61 
 
 		 971 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  53.96 
 
 		 752 aa  640    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  62.52 
 
 		 1035 aa  705    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  58.65 
 
 		 979 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  59.47 
 
 		 860 aa  717    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  50.19 
 
 		 882 aa  713    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  57.04 
 
 		 705 aa  681    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 943 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  57.61 
 
 		 971 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  57.54 
 
 		 854 aa  647    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 		 943 aa  638    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  57.96 
 
 		 972 aa  658    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  46.51 
 
 		 1008 aa  639    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  60.49 
 
 		 679 aa  717    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  60.49 
 
 		 679 aa  717    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  65.91 
 
 		 822 aa  813    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  59.08 
 
 		 924 aa  660    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  55.78 
 
 		 656 aa  635    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  58.13 
 
 		 986 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  48.63 
 
 		 882 aa  749    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  57.96 
 
 		 971 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  53.34 
 
 		 885 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 		 943 aa  638    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  59.54 
 
 		 845 aa  714    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  55.37 
 
 		 673 aa  696    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  58.3 
 
 		 975 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  59.9 
 
 		 688 aa  729    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  57.61 
 
 		 971 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  55.86 
 
 		 962 aa  648    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  53.91 
 
 		 949 aa  642    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  60.93 
 
 		 686 aa  731    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  61.1 
 
 		 686 aa  731    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 921 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 886 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  58.3 
 
 		 975 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  58.13 
 
 		 969 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 945 aa  654    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  57.63 
 
 		 949 aa  675    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  52.97 
 
 		 880 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  56.51 
 
 		 887 aa  633  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  47.45 
 
 		 964 aa  634  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  52.97 
 
 		 880 aa  635  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  57.27 
 
 		 978 aa  632  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 968 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  52.97 
 
 		 880 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  51.34 
 
 		 881 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  53.13 
 
 		 889 aa  634  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>