More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1645 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 
896 aa  638    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  56.51 
 
 
738 aa  662    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  53.98 
 
 
593 aa  639    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  59.97 
 
 
883 aa  738    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  56.24 
 
 
688 aa  761    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  53.53 
 
 
972 aa  657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  55.26 
 
 
896 aa  658    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 
720 aa  746    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 
975 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  54.59 
 
 
964 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  57.06 
 
 
686 aa  772    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  57.49 
 
 
705 aa  688    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  55.59 
 
 
885 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 
986 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  58.21 
 
 
882 aa  722    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 
885 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  56.26 
 
 
686 aa  767    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  56.55 
 
 
686 aa  769    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  56.55 
 
 
686 aa  769    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 
975 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  53.62 
 
 
658 aa  686    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  54.72 
 
 
602 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  66.55 
 
 
1035 aa  735    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  53.37 
 
 
904 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  54.26 
 
 
969 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  55.21 
 
 
966 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  53.14 
 
 
922 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 
975 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  55.35 
 
 
1038 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 
975 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  57.06 
 
 
686 aa  770    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 
975 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  61.1 
 
 
985 aa  768    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  58.97 
 
 
947 aa  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 
972 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  52.35 
 
 
915 aa  662    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  46.01 
 
 
752 aa  676    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  53.98 
 
 
1022 aa  649    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  57.37 
 
 
1079 aa  662    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  59.64 
 
 
884 aa  741    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  55.43 
 
 
984 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  56.26 
 
 
686 aa  767    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  57.44 
 
 
986 aa  724    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  56.49 
 
 
1030 aa  650    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50.45 
 
 
895 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  53.76 
 
 
964 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  60.71 
 
 
903 aa  770    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 
976 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  52.31 
 
 
875 aa  648    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  59.11 
 
 
949 aa  706    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  55.9 
 
 
898 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  56.24 
 
 
688 aa  764    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  54.7 
 
 
907 aa  671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  59.48 
 
 
1131 aa  707    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  54.52 
 
 
989 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  53.6 
 
 
936 aa  654    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  53.1 
 
 
986 aa  644    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  57.49 
 
 
705 aa  688    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  55.06 
 
 
979 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  59.65 
 
 
854 aa  688    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  55.01 
 
 
1011 aa  646    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 
975 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  53.88 
 
 
971 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  52.43 
 
 
689 aa  692    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  61.53 
 
 
888 aa  746    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  54.73 
 
 
673 aa  741    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 
882 aa  644    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  59.31 
 
 
679 aa  798    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  59.31 
 
 
679 aa  798    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  56.55 
 
 
686 aa  770    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  58.85 
 
 
928 aa  662    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 
885 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 
885 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  53.6 
 
 
883 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 
952 aa  650    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  60.07 
 
 
882 aa  732    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 
971 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
692 aa  1376    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  65.02 
 
 
971 aa  777    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  53.37 
 
 
882 aa  642    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 
956 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  55.33 
 
 
968 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  56.34 
 
 
729 aa  659    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  53.88 
 
 
971 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  56.07 
 
 
962 aa  685    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  54.66 
 
 
949 aa  662    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 
889 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 
879 aa  646    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  53.88 
 
 
971 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  58.08 
 
 
921 aa  719    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  52.03 
 
 
991 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 
975 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  54.91 
 
 
896 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  50.94 
 
 
882 aa  638    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  54.38 
 
 
965 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  52.31 
 
 
875 aa  648    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  57.02 
 
 
1079 aa  666    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  54.2 
 
 
911 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 
970 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  57.1 
 
 
689 aa  778    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>