More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4217 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 		 882 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 		 883 aa  681    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 		 892 aa  646    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 		 947 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  49.53 
 
 		 949 aa  656    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 		 884 aa  688    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  51.22 
 
 		 984 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  41.92 
 
 		 985 aa  671    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  48.77 
 
 		 971 aa  635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  100 
 
 		 1011 aa  1998    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  55.78 
 
 		 986 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  55.44 
 
 		 980 aa  674    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  54.93 
 
 		 692 aa  643    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  53.11 
 
 		 962 aa  639    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  57.02 
 
 		 921 aa  680    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 997 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  41.39 
 
 		 940 aa  647    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  55.02 
 
 		 1079 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  54.39 
 
 		 739 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 732 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  43.04 
 
 		 903 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  52.97 
 
 		 1029 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 822 aa  620  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  54.32 
 
 		 1079 aa  622  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  50.32 
 
 		 686 aa  616  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  53.48 
 
 		 686 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 686 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 686 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 686 aa  615  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 686 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  50.23 
 
 		 885 aa  617  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  53.48 
 
 		 686 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  46.2 
 
 		 882 aa  616  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  53.48 
 
 		 689 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 686 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  52.9 
 
 		 720 aa  609  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 		 845 aa  609  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  52.25 
 
 		 705 aa  610  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  52.25 
 
 		 705 aa  610  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 896 aa  612  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  52.03 
 
 		 970 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 1161 aa  611  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.65 
 
 		 898 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  54.53 
 
 		 860 aa  610  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  52.63 
 
 		 688 aa  610  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.32 
 
 		 924 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 896 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  52.68 
 
 		 922 aa  606  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  48.98 
 
 		 884 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 951 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 881 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  52.8 
 
 		 688 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  48.31 
 
 		 949 aa  607  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.33 
 
 		 889 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 946 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 882 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 		 894 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51 
 
 		 885 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  52.01 
 
 		 964 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  50.83 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  50.83 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 873 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  48.34 
 
 		 880 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 880 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  51.17 
 
 		 885 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  51.17 
 
 		 885 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  50.83 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  45.16 
 
 		 921 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  50.83 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 959 aa  601  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 		 894 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  47.51 
 
 		 1058 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  49.07 
 
 		 895 aa  601  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  45.09 
 
 		 888 aa  602  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  52.47 
 
 		 902 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  50.67 
 
 		 868 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 875 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 990 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  48.67 
 
 		 907 aa  599  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 875 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 887 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 868 aa  595  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 1083 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 774 aa  593  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 928 aa  593  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  51.24 
 
 		 886 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  44.86 
 
 		 1008 aa  595  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  47.26 
 
 		 885 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 920 aa  592  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 896 aa  589  1e-167  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0585  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 899 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  52.18 
 
 		 884 aa  591  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0808  translation initiation factor IF-2  49.76 
 
 		 900 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.925902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 950 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  48.79 
 
 		 897 aa  589  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  50 
 
 		 843 aa  590  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 856 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 679 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 679 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 879 aa  589  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>