More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1132 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 738 aa  1465    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  56.21 
 
 		 732 aa  643    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  55.46 
 
 		 686 aa  641    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  48.81 
 
 		 882 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  50.96 
 
 		 985 aa  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  56.53 
 
 		 692 aa  655    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  56.57 
 
 		 739 aa  641    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  72.19 
 
 		 602 aa  885    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  55.9 
 
 		 903 aa  656    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  48.25 
 
 		 1029 aa  687    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  55.86 
 
 		 822 aa  637    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  48.57 
 
 		 888 aa  646    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  55.73 
 
 		 971 aa  654    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  59.73 
 
 		 656 aa  683    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3681  translation initiation factor IF-2  75.97 
 
 		 753 aa  900    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00576781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  53 
 
 		 1161 aa  635    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  52.03 
 
 		 860 aa  644    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  58.39 
 
 		 845 aa  638    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 986 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  53.81 
 
 		 679 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  53.81 
 
 		 679 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  53.63 
 
 		 883 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  51.89 
 
 		 884 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  49.62 
 
 		 980 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  57.07 
 
 		 1035 aa  625  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.58 
 
 		 921 aa  625  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  49.63 
 
 		 922 aa  612  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  49.08 
 
 		 947 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  54.07 
 
 		 720 aa  609  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 949 aa  611  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  55.77 
 
 		 924 aa  610  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  52.16 
 
 		 593 aa  605  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  53.36 
 
 		 689 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_855  translation initiation factor 2 (IF-2)  51.85 
 
 		 593 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00962289  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  49.93 
 
 		 964 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 686 aa  602  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 686 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  52.53 
 
 		 686 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  52.53 
 
 		 686 aa  599  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 686 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  48.83 
 
 		 964 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 686 aa  602  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  44.71 
 
 		 882 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  51.76 
 
 		 673 aa  598  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  53.44 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 		 688 aa  597  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  52.78 
 
 		 705 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  52.92 
 
 		 688 aa  597  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  52.78 
 
 		 705 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 		 593 aa  594  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  52.59 
 
 		 989 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 		 962 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  52.02 
 
 		 853 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  48.6 
 
 		 971 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  52.75 
 
 		 965 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  52.17 
 
 		 986 aa  591  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  51.83 
 
 		 979 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  48.13 
 
 		 882 aa  590  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  49.1 
 
 		 964 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53.5 
 
 		 920 aa  585  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  52.16 
 
 		 854 aa  586  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  48.6 
 
 		 971 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  51.84 
 
 		 971 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  48.6 
 
 		 971 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  50.89 
 
 		 1131 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 975 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 845 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  48.89 
 
 		 972 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 1005 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 975 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 969 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 975 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 975 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  51.84 
 
 		 972 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  46.52 
 
 		 1079 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 		 904 aa  579  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  51.34 
 
 		 975 aa  582  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  51.34 
 
 		 975 aa  582  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 		 984 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 876 aa  579  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  51.17 
 
 		 976 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  51.34 
 
 		 975 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  46.57 
 
 		 907 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  53.15 
 
 		 856 aa  579  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  49.25 
 
 		 885 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 892 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  48.84 
 
 		 895 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.24 
 
 		 894 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  53.81 
 
 		 887 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 945 aa  574  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 875 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 911 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 711 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.24 
 
 		 898 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 968 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 875 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 883 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 879 aa  573  1.0000000000000001e-162  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 		 927 aa  571  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>