More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0381 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  65.28 
 
 
752 aa  798    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  63.37 
 
 
720 aa  780    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  64.91 
 
 
688 aa  783    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  65.76 
 
 
686 aa  788    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
927 aa  1891    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  65.42 
 
 
686 aa  787    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  65.76 
 
 
686 aa  788    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  65.76 
 
 
686 aa  788    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  58.83 
 
 
860 aa  700    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  63.2 
 
 
705 aa  759    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  65.42 
 
 
686 aa  787    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  64.36 
 
 
732 aa  791    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  42.45 
 
 
903 aa  653    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  42.81 
 
 
971 aa  704    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  65.42 
 
 
689 aa  783    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  65.59 
 
 
686 aa  787    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  64.91 
 
 
688 aa  785    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  47.12 
 
 
985 aa  679    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  54.72 
 
 
679 aa  637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  54.72 
 
 
679 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  63.2 
 
 
705 aa  759    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 
1161 aa  652    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  42.27 
 
 
882 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  65.76 
 
 
686 aa  788    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  72.01 
 
 
950 aa  952    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  60.47 
 
 
829 aa  716    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  49.11 
 
 
882 aa  835    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  54.47 
 
 
834 aa  765    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  73.69 
 
 
943 aa  1282    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  64.22 
 
 
739 aa  779    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  50.3 
 
 
1029 aa  636    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  53.24 
 
 
822 aa  634  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.2 
 
 
884 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  53.79 
 
 
883 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 
986 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  53.77 
 
 
882 aa  618  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  45.33 
 
 
845 aa  618  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 
980 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  52.84 
 
 
920 aa  613  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.88 
 
 
949 aa  609  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  53.42 
 
 
686 aa  611  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.79 
 
 
692 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.13 
 
 
924 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  53.62 
 
 
947 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 
888 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl295  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 
629 aa  600  1e-170  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000364465  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  52.25 
 
 
879 aa  601  1e-170  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  43.16 
 
 
1131 aa  599  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.32 
 
 
921 aa  601  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  44.23 
 
 
894 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 
1116 aa  595  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  51.83 
 
 
873 aa  592  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  46.91 
 
 
895 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  45.87 
 
 
889 aa  586  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  42.28 
 
 
964 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 
936 aa  587  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 
943 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  52.83 
 
 
943 aa  586  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  51.29 
 
 
915 aa  587  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  49.53 
 
 
992 aa  586  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 
990 aa  586  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 
945 aa  584  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 
959 aa  585  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 
711 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  44 
 
 
848 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  38.21 
 
 
908 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.4 
 
 
922 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 
984 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  51.1 
 
 
943 aa  583  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  38.03 
 
 
908 aa  585  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 
856 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  44.44 
 
 
881 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  47.73 
 
 
949 aa  584  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  47.59 
 
 
882 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  48.26 
 
 
902 aa  585  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  48.29 
 
 
898 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  49.42 
 
 
1079 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  51.96 
 
 
979 aa  582  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 
880 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 
880 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  45.53 
 
 
845 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 
880 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 
978 aa  582  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 
880 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 
738 aa  579  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 
984 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 
880 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 
991 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 
986 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 
917 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 
997 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  45.85 
 
 
907 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 
989 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  51.55 
 
 
673 aa  577  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 
891 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 
952 aa  579  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  47.02 
 
 
885 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  47.02 
 
 
885 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  45.67 
 
 
968 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 
896 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>