More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0059 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  59.44 
 
 		 1079 aa  1147    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  62.46 
 
 		 883 aa  759    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 822 aa  669    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  57 
 
 		 845 aa  647    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.75 
 
 		 896 aa  668    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 720 aa  644    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 		 986 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  53.99 
 
 		 964 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 		 686 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 		 889 aa  656    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  54.48 
 
 		 896 aa  654    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 		 880 aa  658    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  59.48 
 
 		 732 aa  689    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 885 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  51.58 
 
 		 964 aa  641    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  54.17 
 
 		 945 aa  652    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  48.36 
 
 		 860 aa  636    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  62.12 
 
 		 980 aa  753    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 975 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  55.4 
 
 		 943 aa  649    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 		 1029 aa  682    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  52.37 
 
 		 896 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  55.89 
 
 		 984 aa  660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  80.78 
 
 		 1079 aa  1028    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  53.71 
 
 		 949 aa  736    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  56.32 
 
 		 966 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 922 aa  649    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  56.77 
 
 		 689 aa  641    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  54.79 
 
 		 948 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 		 975 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  52.88 
 
 		 964 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  58.03 
 
 		 884 aa  676    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 		 880 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  45.4 
 
 		 947 aa  733    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  52.8 
 
 		 972 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 		 880 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  54.07 
 
 		 848 aa  640    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 		 686 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  62.23 
 
 		 884 aa  764    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  70.09 
 
 		 984 aa  1026    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  55.67 
 
 		 1161 aa  680    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  67.28 
 
 		 892 aa  906    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 975 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  56.35 
 
 		 692 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 975 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  60 
 
 		 739 aa  692    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 970 aa  682    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  60 
 
 		 903 aa  702    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 		 976 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 		 950 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  54.46 
 
 		 943 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 		 975 aa  662    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 898 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  50.75 
 
 		 888 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  52.42 
 
 		 985 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 		 972 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  52.07 
 
 		 907 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 895 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 		 989 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 884 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 854 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  54.73 
 
 		 843 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 880 aa  664    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 965 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.18 
 
 		 979 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 		 975 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  50.78 
 
 		 1011 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  55.96 
 
 		 951 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  53.95 
 
 		 897 aa  643    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 		 971 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 		 953 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  53.32 
 
 		 869 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 		 971 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  47.18 
 
 		 1008 aa  646    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  57.99 
 
 		 986 aa  755    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  55.96 
 
 		 946 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  54.41 
 
 		 894 aa  658    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  55.23 
 
 		 943 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 		 885 aa  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 		 885 aa  668    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  50.07 
 
 		 968 aa  648    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  54.99 
 
 		 881 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  43.03 
 
 		 882 aa  687    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 		 894 aa  654    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 		 971 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 997 aa  1979    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  53.78 
 
 		 992 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  54.59 
 
 		 868 aa  645    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 969 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 975 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  55.72 
 
 		 882 aa  757    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 		 971 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 		 880 aa  658    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 		 889 aa  668    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  46.5 
 
 		 964 aa  638    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  53.32 
 
 		 885 aa  660    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 		 921 aa  770    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.62 
 
 		 971 aa  687    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 		 940 aa  946    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  52.92 
 
 		 882 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>