More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0747 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 		 890 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 		 890 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 943 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  58.02 
 
 		 883 aa  699    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  67.77 
 
 		 971 aa  852    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  47.72 
 
 		 884 aa  646    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  55.29 
 
 		 894 aa  661    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 		 890 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  64.22 
 
 		 989 aa  829    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  47.22 
 
 		 898 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  54.76 
 
 		 880 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  64.59 
 
 		 836 aa  801    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  55.27 
 
 		 880 aa  655    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  90.46 
 
 		 959 aa  1670    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  54.93 
 
 		 885 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  47.72 
 
 		 892 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 895 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  55.12 
 
 		 896 aa  661    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  55.76 
 
 		 975 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 868 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 		 868 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  55.8 
 
 		 1045 aa  791    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  55.03 
 
 		 972 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  62.42 
 
 		 848 aa  1160    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 		 848 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  53.73 
 
 		 986 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  71.32 
 
 		 883 aa  905    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  52.59 
 
 		 922 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  69.79 
 
 		 871 aa  902    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  58.34 
 
 		 1053 aa  904    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  55.59 
 
 		 975 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  51.15 
 
 		 949 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 		 965 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  64.43 
 
 		 836 aa  801    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  44.37 
 
 		 947 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 		 972 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  60.22 
 
 		 887 aa  749    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 880 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  64.43 
 
 		 838 aa  797    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  57.34 
 
 		 884 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 		 890 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  55.59 
 
 		 975 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  55.04 
 
 		 953 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  55.76 
 
 		 975 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 		 890 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  59.54 
 
 		 873 aa  798    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  52.94 
 
 		 903 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  55.43 
 
 		 976 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  85.01 
 
 		 885 aa  1130    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  60.63 
 
 		 886 aa  914    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  49.73 
 
 		 985 aa  659    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  62.35 
 
 		 824 aa  785    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  55.65 
 
 		 892 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  50.79 
 
 		 854 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  68.62 
 
 		 880 aa  895    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  55.44 
 
 		 907 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  55.65 
 
 		 892 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  54.06 
 
 		 989 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 884 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  70.36 
 
 		 883 aa  889    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  54.13 
 
 		 843 aa  642    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  69.49 
 
 		 868 aa  891    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 		 890 aa  647    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  54.33 
 
 		 979 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  47.72 
 
 		 892 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  54.76 
 
 		 880 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  65.19 
 
 		 835 aa  822    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  56.47 
 
 		 845 aa  694    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 		 971 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  54.95 
 
 		 992 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  55.63 
 
 		 896 aa  668    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  70.49 
 
 		 856 aa  1169    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 964 aa  1929    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  67.87 
 
 		 887 aa  889    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  56.16 
 
 		 831 aa  641    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  90.77 
 
 		 990 aa  1671    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  54.93 
 
 		 885 aa  653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  54.93 
 
 		 885 aa  653    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  65.36 
 
 		 832 aa  811    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  54.78 
 
 		 881 aa  661    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  61.57 
 
 		 1083 aa  932    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  64.04 
 
 		 861 aa  824    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 		 971 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  55.76 
 
 		 975 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  55.76 
 
 		 975 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  54.76 
 
 		 880 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  56.92 
 
 		 898 aa  665    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  55.63 
 
 		 885 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  46.56 
 
 		 894 aa  668    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 		 971 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  63.41 
 
 		 921 aa  927    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  52.64 
 
 		 949 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  54.93 
 
 		 889 aa  653    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 		 890 aa  647    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 		 971 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 		 921 aa  677    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 882 aa  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  65.72 
 
 		 848 aa  807    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  55.59 
 
 		 975 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  55.78 
 
 		 882 aa  659    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>