More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1106 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 		 997 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  56.3 
 
 		 732 aa  651    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  55.74 
 
 		 882 aa  721    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  57.36 
 
 		 883 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 892 aa  652    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 896 aa  1823    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 		 898 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  53.83 
 
 		 774 aa  675    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  42.1 
 
 		 1161 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 		 985 aa  689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  56.23 
 
 		 692 aa  652    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  56.68 
 
 		 986 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 		 947 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.85 
 
 		 884 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  50.88 
 
 		 984 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  56.68 
 
 		 949 aa  656    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 739 aa  653    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  49.11 
 
 		 903 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  55.13 
 
 		 980 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  54.42 
 
 		 907 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  54.48 
 
 		 1079 aa  657    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.71 
 
 		 971 aa  687    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  55.31 
 
 		 1079 aa  646    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  50.21 
 
 		 860 aa  660    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  44.1 
 
 		 882 aa  666    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  55.21 
 
 		 822 aa  687    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  48.76 
 
 		 1029 aa  660    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 880 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  58.61 
 
 		 962 aa  681    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 889 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  55.48 
 
 		 924 aa  659    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  55.45 
 
 		 921 aa  688    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  55.63 
 
 		 882 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  53.14 
 
 		 882 aa  638    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 940 aa  639    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  53.48 
 
 		 885 aa  635  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 		 1010 aa  635  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 885 aa  635  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 885 aa  635  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  52.55 
 
 		 881 aa  634  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  54.41 
 
 		 720 aa  630  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  53.14 
 
 		 880 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  53.14 
 
 		 880 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  53.14 
 
 		 880 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  53.14 
 
 		 880 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  52.64 
 
 		 885 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 945 aa  628  1e-178  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  53.06 
 
 		 884 aa  628  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  52.04 
 
 		 896 aa  626  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  54.36 
 
 		 705 aa  624  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 922 aa  624  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  52.37 
 
 		 920 aa  624  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  55.46 
 
 		 845 aa  625  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  54.36 
 
 		 705 aa  624  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  47.33 
 
 		 1008 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.92 
 
 		 888 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  48.78 
 
 		 956 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  54.25 
 
 		 968 aa  622  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  49.23 
 
 		 1058 aa  620  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  52.24 
 
 		 879 aa  620  1e-176  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  52.46 
 
 		 875 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.69 
 
 		 896 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  52.46 
 
 		 875 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  52.9 
 
 		 689 aa  622  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  53.99 
 
 		 882 aa  620  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  50.47 
 
 		 943 aa  615  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 972 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  54.42 
 
 		 976 aa  618  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 853 aa  618  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 972 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  52.03 
 
 		 894 aa  618  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 971 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 971 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 971 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 936 aa  616  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 971 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  52.37 
 
 		 949 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  52.33 
 
 		 686 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 891 aa  615  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 965 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  53.44 
 
 		 686 aa  615  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  52.33 
 
 		 686 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  52.49 
 
 		 686 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 		 1022 aa  615  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 964 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  52.36 
 
 		 902 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.14 
 
 		 979 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  52.76 
 
 		 688 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 		 894 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 969 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 991 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  51.79 
 
 		 895 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  51.98 
 
 		 979 aa  610  1e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 884 aa  609  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 964 aa  611  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  52.6 
 
 		 686 aa  612  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  53.91 
 
 		 904 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  52.43 
 
 		 686 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  51.16 
 
 		 873 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  53.14 
 
 		 964 aa  612  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>